Meny

Javascript verkar inte påslaget? - Vissa delar av Lunds universitets webbplats fungerar inte optimalt utan javascript, kontrollera din webbläsares inställningar.
Du är här

DNA-sekvenseringsinformatik I, 7,5 hp

BINP28

Den här “hands on”-kursen ger dig erfarenhet och verktyg för att kunna analysera data från “next generation sequencing”. Kursen fokuserar på analys av:

  • transkriptom-data
  • amplikon-data
  • genom-data

Du arbetar i Linux-miljö och får möjlighet att fördjupa dig i Bash, Perl och webb-programmering.

Områden som vi tar upp är:

  • assemblering
  • differentiellt uttryck
  • variantanalys
  • genprediktion
  • annotering
  • analys av samhällsstuktur

I slutet på kursen är det en veckas projektarbete. Notera att nästan alla kursmoment har obligatorisk närvaro.

Sidansvarig:

Studievägledare

Lotta Persmark
Studievägledare
Utbildningskansliet

Telefon: 046-222 37 28
E-post: Lotta [dot] Persmark [at] biol [dot] lu [dot] se

Huvudlärare

Björn Canbäck
Univeristetslektor
Molekylär cellbiologi

Telefon: 046-222 94 19
E-post: Bjorn [dot] Canback [at] biol [dot] lu [dot] se

Kurslitteratur

Utdelat material

Kursperiod

Kursen går under period 1 på vårterminen. Undervisningsspråk är engelska.

Schema

Schema (pdf; 13 kB)

Tentatillfällen

Omtentamen och uppsamlingstentor